曾經，人類與擁有兇惡咒術力的女王——妃魅禍率領的邪魔臺王國的埴輪幻神發生過壯絕的戰爭，戰爭最后以人類封印了妃魅禍而獲得了勝利。 在那場戰爭的50年后，人類在平靜的生活中漸漸忘記了那場戰爭。但是，埴輪幻神又一次出現了！與它們展開戰斗的是司馬遷次郎博士率領的BUILD BASE。 高校生草剃劍兒借著由從BIG SHOOTER射出的各種部件裝著組合而成“鋼鐵神吉克”，與它們展開了激烈的戰斗。關系到人類存亡的新的戰斗開始了……