主角·賴川浩司，是一名記者。因日本出現怪異現象，所以他便前往調查究竟。原來怪異現象的來源是由另一個天體來的機械獸母艦（又譯“復古母體”）所為，它曾經在千萬年前降臨過一次地球。恐龍的滅絕也是它的所為，現在他再次到地球并且想滅絕人類。浩司的好友木村加奈被機械獸母艦捉往做祭品，浩司也因此被殺，幸得地底人將他重新改造，并且注入J POWER力量使他成為假面騎士J并與機械獸母艦的三使者·卡賴、亞基度和亞魅戰斗，全劇的最后便和機械獸母艦決戰，拯救人類。